Фамилия Матишов образована от производной формы крестильного имени Матвей — Матиш. Имя Матвей пришло из древнееврейского языка и означает «дарованный Богом», а в русской народной традиции давало десятки уменьшительных и обиходных вариантов: Матя, Матюха, Матюша и, в том числе, Матиш. Именно эта форма и легла в основу фамилии, закрепившись за потомком человека по имени Матиш.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: суффикс -ов присоединялся к основе, оканчивающейся на шипящий, что типично для русских фамилий, образованных от личных имён и прозвищ. Такая модель была особенно распространена в северных и центральных русских говорах, где формы вроде Матиш, Фомиш или Демиш встречались чаще, чем в литературном языке. Поэтому фамилию Матишов смело можно считать русской по способу образования, хотя имя-основа имеет библейские корни.

Покровителем имени Матвей почитается апостол и евангелист Матфей Левий. До встречи с Христом он был мытарем, то есть сборщиком податей, — занятием, которое в древней Иудее считалось презренным. Однако, вняв слову Господа, Матфей оставил своё дело и последовал за Учителем, а позже написал одно из четырёх Евангелий. Эта история придаёт фамилии дополнительный смысловой оттенок: в народном сознании имя Матвей ассоциировалось не только с даром Божьим, но и с возможностью духовного перерождения.

Встречаются и другие версии происхождения основы Матиш. В южнославянских языках, например в болгарском и сербском, существует имя Матиш как самостоятельная форма того же Матфея. Однако для русской фамилии более вероятно местное, диалектное происхождение: в старых писцовых книгах встречаются крестьяне и посадские люди с именованием Матиш, от которого без натяжки выводится фамилия. Версия о прозвище, связанном с глаголом «матить» (в некоторых говорах — «мешать, путать»), выглядит надуманной и не находит подтверждения в ономастических источниках.

Таким образом, фамилия Матишов — это классический пример русской фамилии-отчества, возникшей не от полного канонического имени, а от его живой, разговорной формы. Предки современных Матишовых, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, чьё имя в быту звучало как Матиш, а дети и внуки уже писались Матишовыми.