Фамилия Мациборко напрямую говорит о том, чьим сыном был первый носитель этого родового имени. Формант -ко в украинской традиции — типичный показатель родства: так называли «малого Мацибора», то есть сына человека с именем или прозвищем Мацибор. Со временем приставка «сын» отпала, а сам Мациборко стал самостоятельной фамилией, закрепившись за потомками.

Сам корень Мацибор — темный и неочевидный. Наиболее распространенная версия возводит его к староболгарскому слову «мацабар» — так называли неряшливого, неловкого человека. В украинском языке есть близкая по звучанию и смыслу лексема «мацапура» с тем же значением. Если придерживаться этой гипотезы, именование Мацибор давали по внешним чертам или манере поведения: предположительно, так могли подметить неопрятность или неуклюжесть.

С этим значением связан любопытный исторический контекст. В средневековой Европе мытье считалось греховным: существовало поверье, что вода смывает святую воду крещения. Бани в Европе практически исчезли, люди годами не знали воды. Православные славяне, напротив, держали бани даже в самых бедных дворах. Баня вернулась в Европу только в XVIII веке: Петр I, побывав в Амстердаме и Париже, приказал соорудить бани для своих солдат, а после 1812 года русская армия построила их во всех странах, освобожденных от Наполеона. Поэтому не исключено, что прозвище Мацибор могло относиться к представителям европейских народов, для которых гигиена была под запретом, — но эта версия остается лишь догадкой.

Правдоподобнее выглядит другой путь. Мацибор мог быть мирским именем, которое родители давали ребенку в дополнение к церковному, по древней традиции. Такие имена часто выполняли охранительную функцию: называя сына Мацибором, родители как бы заранее приписывали ему черты, которые хотели бы видеть. Здесь возможен и защитный смысл: имя-оберег должно было отвести от ребенка беду. Позже прозвище Мацибор, изначально шедшее рядом с крестильным именем, полностью вытеснило его и в быту, и в документах. Так фамилия Мациборко и закрепилась в наследственном употреблении, сохранив память о родоначальнике — человеке, которого звали Мацибором.