Фамилия Матукин образована от имени Матука, производной формы крестильного мужского имени Матвей. Оно, в свою очередь, имеет древнееврейское происхождение и в переводе означает «дарованный богом». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Матука, со временем получил фамилию Матукин.