Фамилия Майсин — редкий случай, когда исходное слово почти наверняка не русское, а тюркское или арабское, и образована она по чисто русской модели. Основа здесь — имя или прозвище Майса (или Майсы). В тюркских языках, особенно в татарском и башкирском, слово «майсы» означает «маслянистый», «жирный», но в переносном смысле — «богатый», «зажиточный», «сытый». Человек мог получить такое прозвище за достаток, тучность или, напротив, иронично — за худобу. Есть и другая версия: от арабского имени Майса (в значении «красивая походка», «горделивая»), которое встречается у народов, исповедующих ислам.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Майсин, то есть сын или потомок Майсы. Эта модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а или -я (ср. Пушкин, Ильин). То, что фамилия «Майсин» звучит по-русски, но корень уходит в степные языки, говорит о смешанной этнической среде: её носители могли быть обрусевшими татарами, башкирами, чувашами или выходцами из Средней Азии, которые приняли православие и получили фамилию по отцу.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Приуралью — в Татарстане, Башкортостане, Самарской и Оренбургской областях она встречается чаще, чем в центральной России. В дореволюционных переписях Майсины могли числиться как государственные крестьяне или мещане. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это «низовая», народная фамилия, возникшая в среде крестьян и посадских людей.

Если копнуть глубже, у фамилии есть редкий «двойник» — Майсин с ударением на первый слог (Мáйсин). В таком варианте основа могла быть от старого русского слова «майса» — так в некоторых говорах называли небольшую лодку-долблёнку. Тогда предок был лодочником или рыбаком. Но эта версия менее надёжна: в письменных источниках «майса» в значении «лодка» встречается редко и локально. Куда вероятнее, что корень — тюркский, а русский суффикс просто «пришил» фамилию к восточному прозвищу.