Фамилия Мазар — одна из тех, что напрямую выводит к культовой географии. Её основа — арабское слово «мазар», то есть «место, которое посещают». Изначально так называли могилы мусульманских мучеников, распространителей веры и суфийских святых, а затем — любые почитаемые объекты домусульманских религиозных культур, вплоть до природных объектов и могил предков. Мазары всегда располагались в местах, значимых для коллективных собраний: к ним шли паломники, приносили жертвы, проводили ритуалы и читали молитвы, обращаясь к святому за помощью или заступничеством.

Скорее всего, прозвище Мазар получил человек, живший рядом с таким местом или постоянно его посещавший. В тюркоязычной среде, где слово прижилось особенно прочно, прозвище могло закрепиться за сторожем мазара, паломником или просто жителем соседнего села.

Фамилия не имеет типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский), что указывает на её позднее оформление или сохранение в исходной, «голой» форме. Встречается она преимущественно у народов Поволжья (татары, башкиры), Средней Азии и Северного Кавказа — там, где мазары были частью повседневного ландшафта. В русских документах фамилия редка: её носители — либо потомки крещёных татар, либо люди, получившие фамилию при переписях по месту жительства.

Слово «мазар» может быть и топонимом: например, в Крыму есть гора Мазар, в Узбекистане — десятки кишлаков с названием Мазар. В таком случае фамилия могла возникнуть от названия родного села или урочища.