Фамилия Мещерюкова — женская форма фамилии Мещерюков. Её основа — прозвище или мирское имя Мещерюк, которое образовано от названия финно-угорского племени мещера. Мещера обитала в среднем течении Оки, на территории нынешних Рязанской, Владимирской и Московской областей, и к XVI—XVII векам была в основном ассимилирована славянами. Слово «мещеряк» (или «мещерюк») в русских говорах означало выходца из Мещерского края. Так могли прозвать переселенца из тех мест — человека, который перебрался в другой уезд и получил прозвище по старой родине.

Фамилия образована по продуктивной модели с суффиксом -юк, характерным для юго-западных русских и украинских земель. Суффикс -юк (вместо более частого -ов/-ев) указывал на принадлежность: «Мещерюк» — сын или потомок Мещеры (то есть выходца из Мещеры). В центральной России такую форму могли занести переселенцы с юго-запада, либо она возникла локально, под влиянием диалектной нормы. Затем к основе добавился патронимический суффикс -ов, а окончание -а указывает на женский род носительницы.

Встречается два варианта написания: Мещерюков и Мещеряков. Они однокоренные, но различаются суффиксальной огласовкой. Мещерюков — более редкая форма, она сохранила архаичный звук «ю» в суффиксе, который в массовом варианте фамилии вытеснился «я» (Мещеряков). Носительницы фамилии Мещерюкова, скорее всего, происходят из семей, где предки жили в Рязанской, Тамбовской или Нижегородской губерниях — именно там чаще фиксировалась форма с «ю». Сословная принадлежность могла быть любой: от крестьян до однодворцев, но прозвище по месту выхода, а не по роду занятий, говорит о том, что предок не был приписан к какому-то одному ремеслу, а просто сменил место жительства.