Фамилия Миховов — редкий случай, когда в основе лежит не имя, а вариант имени, причем с двойным патронимическим суффиксом. Разберем по порядку.

Корень — «Мих-», усеченная форма от имен Михаил или Михей. В русской традиции такие сокращения были нормой: Мих, Михей, Миханя. К основе добавили суффикс «-ов-», который в этой позиции указывает на принадлежность: Михов — буквально «сын Миха» или «сын Михея». Но фамилия не остановилась на этом: к «Михову» прирос второй суффикс — «-ов». Так получился Миховов — «сын Михова». Двойное окончание характерно для северных и центральных областей России, где фамилии нередко «наслаивались» при переписях или когда отчество закреплялось за родом как фамилия, а затем к нему добавляли еще одно отчество.

Вероятнее всего, предок носителя фамилии — человек по имени Мих (Михаил или Михей), а его сына в документах записали как Михов (то есть «Михов сын»). Внук же получил фамилию Миховов — уже по отцу. Такая цепочка не редкость: например, фамилии Ершовов, Петровов, Кузьмовов встречаются в переписных книгах XVII–XVIII веков. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные модели описаны как «вторичные патронимы», возникавшие в условиях, когда первое отчество уже стало фамилией, но требовалось уточнить новое поколение.

Географически фамилия Миховов тяготеет к северо-востоку: единичные записи встречаются в Вологодской и Костромской губерниях, а также в Пермском крае. В современной России она остается редкой — в базе данных ЗАГСов насчитывается не более нескольких сотен носителей. Сословная принадлежность, скорее всего, крестьянская или посадская: сложные патронимические фамилии у дворян почти не встречались, а в среде крестьян и ремесленников они фиксировались при подворных описях.

Других версий происхождения, кроме как от имени Мих, нет. Связь с диалектным «миховатый» (неуклюжий) маловероятна: суффикс «-ов» в основе указывает на именную, а не качественную природу.