Фамилия Минабуддинова — редкий пример того, как сложная арабская основа соединилась с русским суффиксом, при этом сохранив почти полную прозрачность исходного смысла. Разбирать её стоит не с корня, а с конечного суффикса -ова: это типичный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность («чья?» — Минабуддиновых дочь или жена). Мужская форма — Минабуддинов. Именно по ней и восстанавливается вся цепочка.

В основе лежит составное арабское имя Минабуддин. Это теофорное имя: первая часть «Мина» восходит к арабскому слову со значением «гавань», «пристань», но в именах часто выступает как сокращение от «иман» (вера) или как самостоятельный элемент. Вторая часть — «уд-дин» (араб. «ад-дин» — религия, вера). В сумме получается «гавань веры» или «опора религии». Такие имена характерны для мусульманской традиции, особенно в среде татар, башкир и народов Кавказа, где арабские заимствования переплетались с местными обычаями имянаречения.

Фамилия образована от отчества: отца человека звали Минабуддин. Когда в XIX — начале XX века у татар и других мусульманских народов Российской империи начали массово фиксировать фамилии по русским образцам, к имени отца добавляли суффиксы -ов/-ев или -ин. Так Минабуддиновы — это буквально «потомки Минабуддина». Географически фамилия тяготеет к регионам с компактным проживанием татар (Татарстан, Башкортостан) и к некоторым районам Дагестана, где арабские имена сохранялись дольше.

Примечательно, что в русском языке имя Минабуддин почти не встречается в виде фамилии без конечного суффикса — в отличие, например, от фамилий на -иев или -оглы, которые оставляли основу нетронутой. Это говорит о том, что носители фамилии прошли полную русификацию документального оформления. Других версий происхождения, кроме арабской, у фамилии нет: попытки связать её с греческим «мина» (мера веса) или с русским диалектным «минать» (мять) наталкиваются на очевидное несоответствие структуре слова.