Фамилия Минькин напрямую связана с именем Михаил. В основе лежит не само полное имя, а его просторечная уменьшительная форма — Минька. Так в старину в крестьянской и мещанской среде могли звать Михаила, и от этого обиходного прозвища и пошла фамилия: Минька — Минькин, то есть «сын Миньки».

Имя Михаил в переводе с древнееврейского означает «благонравный» или «тот, кто подобен Богу». Святым покровителем имени считается Архангел Михаил, предводитель небесного воинства, день памяти которого Русская православная церковь отмечает 8 ноября по старому стилю (21 ноября по новому). В народном календаре этот день называли Михайловым днём, и он был одним из самых почитаемых осенних праздников, что косвенно подтверждает распространённость имени и его производных форм.

Модель образования здесь типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность. Если отец носил прозвище Минька, то его дети автоматически получали определение «Минькины дети», которое со временем закрепилось как фамилия. Аналогичным образом возникли, например, Ивашкин (от Ивашка), Петькин (от Петька) или Васькин (от Васька).

Интересно, что форма Минька не единственная уменьшительная от Михаила. В ходу были и другие: Миша, Мишка, Миха, Миня, Минай. От каждого из них образовались самостоятельные фамилии — Мишин, Мишкин, Минихин, Минаев. Фамилия Минькин стоит в этом ряду особняком, потому что сохранила именно ту форму, которая сегодня почти вышла из устного обихода, но закрепилась в документах.

Стоит упомянуть и редкую возможность иного толкования. В некоторых говорах слово «минька» могло использоваться как ласковое обращение к маленькому ребёнку, независимо от его имени, примерно как «кроха» или «малыш». Однако эта версия менее правдоподобна: подавляющее большинство носителей фамилии, судя по архивным записям, происходят из семей, где в роду был Михаил. Поэтому основная и наиболее убедительная версия — происхождение от канонического имени через уменьшительную форму.

Фамилия Минькин встречается в разных регионах России, но чаще всего в Поволжье и центральных областях. Это объясняется тем, что имя Михаил было одним из самых частых при крещении, а деревенские священники и писари при записи нередко использовали не официальное имя, а то, как человека звали в быту. Так Минька попадал в метрические книги, и его потомки навсегда получали фамилию, которая сегодня звучит для нас немного старомодно, но несёт в себе живую память о предке.