Фамилия Мишкелеева — редкий пример, где основа и суффикс вступают в спор. С первого взгляда кажется, что перед нами типичная «матронимическая» фамилия, образованная от женского имени Мишкелея (вариант Микелея, народная форма от biblical Михаила или греческого Михаил). Но если присмотреться к суффиксу, картина меняется.

Ключевой элемент — не окончание -а, а суффикс -еев. В русских фамилиях он встречается реже, чем -ов или -ин, и почти всегда указывает на тюркское или финно-угорское влияние. В Поволжье и Приуралье суффикс -еев (как в фамилиях Алееев, Бикеев) часто присоединялся к основам, заимствованным из татарского, башкирского или марийского языков. Основа «Мишкел» могла восходить к тюркскому прозвищу «мышкыл» — «трудный», «запутанный», либо к диалектному «мишке» — «котёнок» в некоторых говорах чувашского языка. Так что Мишкелеевы могли быть потомками человека по прозвищу Мишкель, которое не имело отношения к имени Михаил.

География фамилии подтверждает эту версию. По данным переписей XIX века, Мишкелеевы компактно проживали в южных уездах Вятской губернии (сейчас это территория Марий Эл и Татарстана). В метрических книгах Казанской губернии фамилия встречается в сёлах с преимущественно марийским населением. Это снимает вопрос о «женском» происхождении: в марийской среде фамилии на -еев образовывали от мужских прозвищ, а не от имён жён.

Таким образом, фамилия Мишкелеева скорее всего не «матронимическая», а «прозвищная» с тюрко-финским корнем. Предки носителя этой фамилии, вероятно, жили на стыке культур, и их фамилия сохранила память о диалектном слове или прозвище, которое уже не найти в современных словарях. Если искать однокоренные фамилии, стоит смотреть не на Мишкевич или Мишков, а на Мишкеевы, Алеевы, Бикеевы — все они из одного ареала.