Фамилия Мистюрин — редкий пример того, как за одним прозвищем могут стоять сразу две совершенно разные истории. Образована она по стандартной для русских фамилий модели: от личного прозвища Мистюра с помощью патронимического суффикса -ин. Этот суффикс указывал на принадлежность: Мистюрин буквально значит «сын Мистюры». Сам суффикс — один из древнейших, он использовался наравне с -ов/-ев, и фамилии на -ин чаще всего возникали от основ, оканчивающихся на -а или -я.

Самая правдоподобная версия происхождения прозвища ведет к диалектному слову «мистрюк». В пермских и вятских говорах так называли нелюдимого, угрюмого человека. В этом случае Мистюрой могли прозвать молчаливого, серьезного мужчину, возможно, склонного к уединению. Однако у этого прозвища могла быть и обратная, «охранительная» функция. В крестьянской среде часто давали детям имена-обереги с негативным значением, чтобы отвести злые силы. Надеясь вырастить веселого и здорового сына, родители нарочно называли его Мистюрой — мол, нечего ангелам и бесам зариться на «угрюмого» ребенка.

Существует и альтернативная версия, связанная с украинскими диалектами. Там слово «мистюк» встречается в значении «мастак», то есть искусный, опытный мастер. Если принять эту гипотезу, то родоначальник Мистюриных был не отшельником, а наоборот — уважаемым ремесленником, чье умение ценили окружающие. Обе трактовки имеют право на жизнь, и без точных сведений о месте проживания первых носителей фамилии выбрать одну из них сложно.

Сама фамилия звучит довольно архаично. Она не получила широкого распространения, что характерно для прозвищ, закрепившихся в пределах одной местности или даже одной семьи. В документах такие фамилии фиксировались редко, поэтому сегодня Мистюрины — это, скорее всего, потомки жителей тех самых северных и приуральских регионов, где бытовало слово «мистрюк».