Фамилия Мистюков напрямую связана с прозвищем Мистюк, которое, в свою очередь, восходит к украинскому глаголу «мистити». Этот глагол имеет два основных значения — «содержать» и «печатать». От того, какое из них вкладывали в прозвище изначально, зависит и портрет предка.

Если опираться на значение «печатать», то перед нами типичное «профессиональное» именование. Так могли прозвать человека, который работал с текстами: писаря, переписчика или человека, занятого в типографском деле. В эпоху, когда грамотность была редкостью, подобное занятие выделяло человека из общей массы, и прозвище легко закреплялось за ним и передавалось детям.

Вторая версия, связанная со значением «содержать», рисует иной социальный портрет. Мистюком могли назвать человека, который находился на чьём-то содержании, то есть жил за чужой счёт. Впрочем, эта трактовка менее лестная и, возможно, менее распространённая, чем первая, хотя и имеет право на существование.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: к основе Мист- добавляется уменьшительный или обиходный суффикс -юк, характерный для украинских и южнорусских говоров. Такая модель часто указывает на именование по отцу или главе семейства. Позже, при оформлении фамилии по русскому образцу, к прозвищу добавился патронимический суффикс -ов, что дало привычное окончание. Таким образом, Мистюков — это буквально «сын Мистюка», а корень рода, вероятно, происходил с территории современной Украины или из южных регионов России, где подобные формы имён были обычным делом.

Интересно, что фамилия не получила широкого распространения, что говорит о её локальном характере. Вероятно, род Мистюковых берёт начало в конкретной местности, и прозвище основателя не разошлось далеко за её пределы. Сегодня фамилия звучит достаточно редко, но её носители могут с уверенностью связывать свою родословную с человеком, чья деятельность или положение в обществе были связаны с письмом либо с зависимым статусом.