Фамилия Миткинов — редкий случай, когда разбор начинается не с корня, а с суффикса. Перед нами модель на -ин, а не на -ов, что сразу сужает круг возможных основ. В русской ономастике фамилии на -ин традиционно образовывались от основ, оканчивающихся на -а/-я: от женских имён, прозвищ или профессий. Миткинов — исключение из этого правила, поскольку основа «Миткин» сама по себе уже содержит суффикс -ин. Это значит, что фамилия возникла не напрямую от имени, а от другой фамилии или отчества, которое уже было на -ин. Проще говоря: был человек по фамилии Миткин, а его сын или потомок стал Миткиновым — так же, как Иванов происходит от Ивана, а не от Ива.

Сама основа «Миткин» — классическое русское отчество от имени Митка. Митка — это народная, просторечная форма канонического имени Дмитрий. В русском языке имя Дмитрий дало целый веер уменьшительных форм: Митя, Митька, Митюха, Митюша и, конечно, Митка. Форма на -ка в XVI–XVII веках была нейтральной, не грубой, а обычной бытовой. От неё и образовали отчество: «чей сын?» — Миткин. Так появилась фамилия Миткин — одна из многих, построенных по той же модели (Петров → Петькин, Иванов → Ванькин).

Миткинов, таким образом, — это «внук Митки» или «сын Миткина». Удвоение суффикса указывает на более позднее происхождение: фамилия закрепилась в те времена, когда отчества уже перестали быть просто указанием на отца и стали наследственными. Такая модель встречается реже, чем простая, и говорит о том, что носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми — в дворянской среде подобные «двойные» суффиксы почти не встречались.

Географически фамилия Миткинов привязана к центральным и северным регионам России. В переписных книгах XVII века и в ревизских сказках XVIII–XIX веков носители фамилии встречаются в Вологодской, Костромской и Архангельской губерниях. Это объяснимо: именно там была распространена форма имени Митка, а не, скажем, Митрофан или Митрий. В южнорусских говорах и на Украине имя Дмитрий чаще давало формы Дмитро, Димка, поэтому Миткиновы там почти не фиксируются.

Одна из версий, которую иногда выдвигают, — связь с тюркским словом «миткен» (якобы «быстрый» или «ловкий»). Но она не выдерживает критики: во-первых, фамилия имеет прозрачную славянскую словообразовательную структуру, во-вторых, в тюркских языках нет слова с таким значением и звучанием, которое могло бы лечь в основу русского прозвища. Так что основная и единственная убедительная версия — от имени Дмитрий через форму Митка.