Фамилия Мкарихин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа — не «Мкар», а более древняя форма. Чтобы понять корень, нужно отбросить суффикс -ихин. В русских фамилиях суффикс -ихин — вариант суффикса -ин, характерный для северных и центральных областей России (Архангельская, Вологодская, Костромская губернии). Он указывает на принадлежность: «чей?» — «Мкарихин», то есть сын или потомок Мкарихи.

Само имя Мкариха — это не самостоятельное каноническое имя, а народная, просторечная форма от крестильного имени Макарий. В русском языке часто укорачивали и «обкатывали» длинные греческие имена: Макарий превращался в Макар, а в женском или прозвищном варианте — в Мкаря или Мкариху. Согласный «к» мог выпасть при быстром произношении или под влиянием местных говоров, где редуцировали гласные. Таким образом, цепочка выглядит так: Макарий → Макар → Мкаря (прозвище) → Мкариха (жена Мкари, либо женщина с таким прозвищем) → Мкарихин (потомок).

Исходное имя Макарий (греч. makarios — «блаженный», «счастливый») было очень популярно в среде крестьян и духовенства. Поэтому фамилия Мкарихин — это типичный пример «полуотчества»: её дали не по отцу, а по матери или по главе семьи, которую в деревне знали под прозвищем Мкариха. Носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми из северных или поволжских земель, где такие формы на -ихин встречаются чаще всего. Встречается также вариант написания Мкарихин с одной «к» — это не ошибка, а отражение того же фонетического упрощения, которое произошло ещё в основе.