Фамилия Молчанский происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Молчанский, вероятнее всего, образована от названия села Молчаново, которое является административным центром Молчановского района Томской области и Молчановского сельского поселения. Основано в 1702 году беглыми казаками, первоначально называлось Лаврово. Согласно этому, можно предположить, что основатель рода Молчанских был выходцем из этого села. Также возможно, что эта фамилия восходит к древнерусскому нецерковному имени Молчан, которое весьма часто встречается в документах допетровской эпохи. Нарицательное значение этого слова сохранилось в загадке: «Молчан - собачка весь дом стережет» (замок) и в пословице: «Молчан - собака исподтишка хватает». Веселовского упоминаются: Иван Дмитриевич Молчан Чеглоков, первая половина XVI в.; Андрей Борисович Молчан, 1535 г., Вологда; Иван Федорович Молчан Ошанин, 1570 г.; от него пошли Молчановы. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Молчанский, со временем получил фамилию Молчанский. О точном месте и времени возникновения фамилии Молчанский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Молчанский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.