Фамилия Морохотин — один из тех родовых именований, которые звучат непривычно для современного уха, но именно поэтому хранят память о давно ушедшем пласте народной речи. Вопреки возможному ожиданию, корень здесь не связан ни с «мороком», ни с «морем». Основа фамилии — древнерское слово «морох» или диалектное «мороха», которым в разных славянских говорах называли мелочь, крошку, а иногда и хлопотливого, суетливого человека. Отсюда и глагол «морохотить» — то есть крошить, мельчить, а в переносном смысле — суетиться или докучать мелочами.

Словообразовательная модель проста и прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность. Морохотин буквально означает «сын Морохоти» или «человек из семьи Морохоти». Так в старину могли прозвать либо самого суетливого и беспокойного мужика, либо, что вероятнее, мастера, чья работа была связана с крошевом — например, толоконника или того, кто готовил мелкий корм для скота. Прозвище закрепилось за главой семьи, а уже его дети и внуки стали писаться Морохотиными.

Именования, построенные по той же модели — от прозвища с суффиксом -ин, — широко представлены в ономастике восточных, западных и южных славян. Это один из древнейших способов образовать семейное имя, и Морохотины стоят в одном ряду с тысячами других русских родов, чьи фамилии выросли из уличного прозвища, а не из церковного календаря. Подобные фамилии обычно старше дворянских и княжеских: их носили крестьяне, посадские люди и служилые низы, для которых прозвище было единственным способом выделить себя среди односельчан.

Любопытно, что фамилия сохранила архаичное окончание -ин, а не более позднее -ов. Это косвенно указывает на северорусское или сибирское происхождение рода: именно в этих регионах модель с -ин держалась дольше и встречалась чаще, чем в центральной России. Встречается также вариант написания через «а» — Морохатин, что связано с акающим произношением, но основная форма закрепилась в документах как Морохотин.

Процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Морохотин можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований. Однако уже сейчас ясно: фамилия — не случайный набор звуков, а живой след народной речи, в котором зашифрован облик далекого предка — возможно, хлопотливого хозяина, вечно занятого делом, или мастера, чьи руки умели превращать зерно в мелкую крупу.