Фамилия Москалькова — женская форма от Москальков, и её разбор почти сразу даёт ключ к происхождению. В основе лежит прозвище Москалько, которое образовано от слова «москаль» с уменьшительным суффиксом -к-. В русских говорах, особенно южных и западных, «москаль» — это не только историческое название русского (солдата или выходца из Московского государства), но и бытовое прозвище. Однако в фамилиях на -ко, типичных для украинской и белорусской традиции, суффикс часто выполнял уменьшительную или фамильярную функцию: Москалько могло означать «маленький москаль» или «сын москаля». То есть предок носителя фамилии, скорее всего, был выходцем из великорусских земель, поселившимся на территории современной Украины или Белоруссии, либо его отец имел такое прозвище за связь с Москвой.

Суффикс -ов в мужской форме Москальков указывает на принадлежность: «чей сын?» — Москальков. Это типичная русская модель, которая наложилась на украинскую основу. Фамилия встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, а также в областях, граничащих с Украиной, что подтверждает её пограничное происхождение. Стоит отметить, что в отличие от фамилии Москалёв, где суффикс -ев присоединяется к основе на мягкий согласный (Москаль), вариант Москальков сохраняет твёрдое -к-, что говорит о более прямой связи именно с формой Москалько.

Двойная интерпретация здесь не нужна: версия с прозвищем по этническому или территориальному признаку — основная. Альтернативные гипотезы (например, связь с комариным родом мошкары или диалектным «москаль» в значении «скупой») не имеют под собой ни лингвистической, ни исторической опоры. Фамилия Москалькова — это прямой след тех процессов, когда пришлого человека называли по месту его прежнего жительства или по его «московскому» статусу, а потом это прозвище закрепилось за его потомками.