Основой фамилии Мотькина послужило имя Мотька. Скорее всего, фамилия Мотькина образована от имени Мотька – просторечной формы имен Матвей (в переводе с древнееврейского – «дарованный богом») и Матрена (в переводе с латинского – «женщина»). Вероятно, основатель рода Мотькиных был человеком из простого сословия. Согласно другой, менее правдоподобной версии, фамилия Мотькина происходит от прозвища Мотька. Поэтому можно предположить, что Мотькой могли прозвать того, кто занимался мотанием пряжи. Так, Мотькой иногда называли мота, гуляку, кутилу, расточителя. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мотька, со временем получил фамилию Мотькина.