Фамилия Мозгунова ведет начало от прозвища Мозгун. В старину так называли человека грамотного, рассудительного и толкового, к которому окружающие шли за дельным советом. Прозвище закреплялось за тем, кто умел ясно мыслить и находить выход из запутанной ситуации, поэтому Мозгуном нередко становился деревенский староста, писарь или просто уважаемый крестьянин с репутацией мудреца. Отчество от этого прозвища — Мозгунов — и дало начало фамилии: потомки такого человека со временем стали писаться Мозгуновыми, а в женском роде — Мозгуновой.

Словообразовательная модель здесь простая и древняя: суффикс -ун в русских прозвищах указывал на деятеля, склонного к постоянному действию или состоянию. Сравните с однокоренными именами-характеристиками: Молчун — неразговорчивый, Болтун — говорливый, Бегун — быстрый. Мозгун, соответственно, тот, кто постоянно «шевелит мозгами», живет умом. Такие прозвища были широко распространены в северных и центральных русских говорах, где слово «мозговать» означало «думать, размышлять, соображать». Любопытно, что в некоторых диалектах это слово имело ироничный оттенок — так могли подшутить над человеком, который любил пофилософствовать в компании, но в основе прозвища все же лежит уважение к уму.

Интересно, что фамилия Мозгунова не встречается в дворянских родословных книгах — это типично крестьянская или мещанская фамилия, что подтверждает ее происхождение от бытового прозвища, а не от церковного имени. В документах XVII–XVIII веков подобные фамилии фиксировались в основном в переписных книгах посадских людей и государственных крестьян. Родственными по основе будут фамилии Мозгов, Мозгунов, Мозгалев — все они образованы от слов, связанных с умственной деятельностью, и говорят о том, что предки носителей этих фамилий ценились за сметливость и живой ум.

Сегодня фамилия Мозгунова встречается в основном в Поволжье и на Урале, что согласуется с историей расселения крестьян из центральных губерний в XVIII–XIX веках. Носительница этой фамилии может с полным правом считать, что ее предки были людьми неглупыми и практичными — теми, к кому шли за советом и чье слово имело вес в общине.