Фамилия Можарцева — женская форма, а её основа мужская, Можарцев. Разберём эту фамилию с необычной стороны: с редкого суффикса, который сразу выдаёт её происхождение. Большинство русских фамилий оканчивается на -ов/-ев (Иванов) или -ин (Пушкин). Суффикс -цев — более редкая и дробная модель. Он указывает на то, что предка прозвали по месту жительства или по профессии, но не напрямую, а через принадлежность к какой-то группе людей. Можарцев буквально значит «сын можарца» или «человек из можарцев».

Кто же такие «можарцы»? Самая вероятная версия отсылает к топониму Можары. В России есть несколько населённых пунктов с таким названием — например, Можары в Рязанской области или в Башкортостане. Человек, выходец из этих мест, получал прозвище Можарец (житель Можар). А его дети становились Можарцевыми. География бытования фамилии это подтверждает: Можарцевы чаще всего встречаются в Поволжье и на Урале, в зоне расселения бывших служилых людей и крестьян из центральных губерний.

Есть и вторая, более редкая версия. В основе может лежать слово «можара» — так в некоторых говорах называли мажару, то есть большую телегу или воз. Прозвище Можар мог получить возчик, ломовой извозчик. Но эта версия слабее: от слова «можара» скорее образовалась бы фамилия Можаров или Можарин. Суффикс -цев прочно привязан к географическому принципу — он типичен для фамилий, образованных от названий жителей местности (как Ростовцев, Тамбовцев, Казанцев). Поэтому первая версия, с селом Можары, гораздо правдоподобнее.

Фамилия недворянская. В среде крестьянства и однодворцев южных и восточных губерний такие «географические» фамилии были обычным делом: они фиксировали, откуда родом переселенец. В документах XVIII–XIX веков Можарцевы встречаются среди государственных крестьян и мещан Пензенской, Симбирской и Уфимской губерний. В написании фамилии устойчивое -це- (а не -цо- или -цы-), что тоже говорит в пользу книжного, а не диалектного закрепления формы.