Фамилия Мухалтинов — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от множества фамилий на -ов, образованных от крестильных имён или названий профессий, эта, скорее всего, имеет прозвищную основу, связанную с местным говором или иноязычным влиянием.

Ключ к разгадке — основа «мухалт-». В русских говорах, особенно на Урале и в Сибири, слово «муха» и его производные часто использовались в переносном смысле. Глагол «мухалить» (или «мухлить») в некоторых диалектах означал «плутовать, хитрить, обманывать». Соответственно, Мухалта — это прозвище хитрого, изворотливого человека. Суффикс -ин- в фамилии указывает на принадлежность: «чей сын?» — Мухалтина, то есть потомок того самого Мухалты. Форма Мухалтинов возникла, вероятно, под влиянием более распространённой модели на -ов, когда исходное прозвище было переоформлено в более привычную фамилию.

Есть и другая, менее вероятная версия. Она связывает фамилию с тюркским корнем. В татарском и башкирском языках есть слово «мөхәллә» (мухалля) — квартал, часть села. Если предположить, что прозвище Мухалта дали человеку по месту жительства («с такого-то квартала»), то фамилия могла бы означать «выходец из определённого квартала». Однако отсутствие в фамилии характерного тюркского суффикса принадлежности (например, -ов/-ев в русском оформлении) делает эту гипотезу слабой. Гораздо логичнее, что перед нами чисто русское прозвище, зафиксированное в диалектной лексике.

В исторических документах фамилия почти не встречается, что подтверждает её локальный характер. Носители Мухалтиновых, скорее всего, происходят из среды крестьян или однодворцев южных или восточных губерний России, где диалектное слово «мухалить» было в ходу. Сословная принадлежность предков была, вероятно, невысокой: прозвища, отражающие черты характера (пусть и нелестные), давали в простонародье.

Итак, самое правдоподобное объяснение: Мухалтинов — сын хитрого человека, того, кого в народе называли Мухалта. Фамилия — живое свидетельство того, как меткое словечко, брошенное когда-то соседями, закрепилось в роду и дошло до наших дней.