Фамилия Мухлынин образована от прозвища Мухлыня, и чтобы понять её смысл, нужно разобраться, что стояло за этим словом в народной речи. Версий несколько, и все они ведут в разные стороны.

Самая вероятная основа — глагол «мухлять». В народных говорах он означал и «делать кое-как, как ни попало», и «хитрить, лукавить», и даже «ерошить, взбивать». Отсюда и разброс значений прозвища: Мухлыней могли назвать и вечно взъерошенного, непричесанного человека, и пройдоху-хитреца, и просто неумелого или ленивого работника, который всё делал спустя рукава. Согласитесь, характеристика ёмкая — под неё подходил чуть ли не каждый второй в деревне, поэтому фамилия и не стала редкой.

Есть и другая, более неожиданная версия, которая уводит на север. В архангельских говорах бытовало слово «махлай» — так называли ушастую шапку. Если прозвище связано с ним, то Мухлыней могли прозвать человека, который постоянно ходил в такой приметной шапке. Но здесь кроется и третий поворот: прозвища, образованные от названий одежды, часто становились «профессиональными». Не исключено, что предок носителя фамилии Мухлынин сам шил эти самые шапки-ушанки, и его именовали по ремеслу.

Что касается словообразовательной модели, тут всё прозрачно: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть «Мухлынин» буквально значит «сын Мухлыни», потомок человека с таким прозвищем. Это типичная для русских фамилий схема, но сам корень делает её запоминающейся. Из двух основных гипотез первая, связанная с глаголом «мухлять», выглядит убедительнее: у неё шире география и больше смысловых ответвлений. Версия про шапку — скорее локальное, северное явление, хотя и она имеет право на жизнь.