Фамилия Мухортова происходит от прозвища Мухорт, и у этого прозвища, как это часто бывает, несколько возможных значений. Самая прямая версия связывает его с глаголом «мухортаться» — «спесивиться, чваниться, зазнаваться». В этом случае прозвище отражало бы особенности характера предка, этакого гордеца или зазнайку.

Однако есть и другая, более распространённая трактовка. В русских говорах слово «мухортый» означало «слабый, хилый, тощий, малорослый». И вот тут вступает в силу старинный суеверный обычай. На Руси детям часто давали «защитные» прозвища с отрицательным значением, чтобы обмануть злых духов: назовут ребёнка Мухортом, то есть хиляком, а он, назло всем, вырастет здоровым и крепким. Так что прозвище могло быть не обидной насмешкой, а оберегом, пожеланием обратного.

Но был и третий, вполне «лошадиный» смысл. Мухортой называли лошадь гнедой масти с желтоватыми подпалинами у морды и ног. Владельца такой лошади тоже вполне могли окрестить Мухортом — по характерной примете его хозяйства.

Интересно, что однокоренные прозвища фиксируются в документах с XVI века. Например, в исследованиях С. Б. Веселовского упоминаются Мухаил Иванович Мухорт Жировой-Засекин (начало XVI века) и Мухортый Неелов (середина XVI века). Это говорит о том, что прозвище было не редким и бытовало в разных слоях общества — от знати до служилых людей.

Что касается формы фамилии, то здесь всё просто и типично для русской ономастики: к основе Мухорт добавился суффикс -ов, а затем родовое окончание -а. Так что Мухортова — это буквально «дочь (или жена) Мухорта». Фамилия закрепилась за потомками человека с этим прозвищем и сохранилась до наших дней, неся в себе память о далёком предке — то ли заносчивом, то ли хилом, то ли просто удачливом коневоде.