Фамилия Муллыев — яркий пример того, как географическое положение предков напрямую диктует форму фамилии. Её основа — мужское мусульманское имя Мулла, которое в тюркских и иранских языках означает «священнослужитель», «учёный-богослов», «наставник». Человек по имени Мулла — это не обязательно тот, кто носил духовный сан, а тот, кому родители дали имя в честь уважаемого религиозного деятеля. Фамилия образована по русской модели с патронимическим суффиксом -ев, который присоединяется к основам на мягкий согласный или гласный. В данном случае к основе Муллы- (где конечная гласная имени перешла в «ы» по законам русской орфографии) добавили -ев, чтобы получить форму «чей сын?» — Муллыев.

Ключевая деталь, которая выделяет эту фамилию среди десятков похожих (Муллаев, Муллаков, Муллануров), — это ударение. В фамилии Муллыев оно почти всегда падает на первый слог: Мýллыев. Это отличает её от фамилии Муллаев (с ударением на второй слог), которая происходит от арабского имени Муллай или от прозвища мулла в значении «человек, похожий на муллу». Разница в суффиксе и ударении — не случайность, а маркер конкретной региональной традиции: фамилии на -ыев характерны для башкирской и татарской ономастики, особенно для юго-востока Башкортостана и Оренбуржья.

Если говорить о социальном контексте, то носитель фамилии Муллыев с высокой вероятностью происходит из среды башкир или татар, где имя Мулла было распространённым, но не обязательно указывало на духовное сословие. В XIX веке, когда у башкир и татар массово закреплялись фамилии, многие записывали детей по имени отца — так сын простого крестьянина по имени Мулла становился Муллыевым. При этом в родословной мог быть и реальный мулла: в деревнях это звание часто передавалось по наследству, и фамилия могла закрепиться за целым родом потомственных имамов.

Сравните с однокоренными фамилиями: Муллануров (где «нур» — «свет») или Муллагалиев (с арабским «али» — «высокий»). Муллыев — самая простая и прямая форма, без дополнительных компонентов, что говорит о её древности: она возникла раньше, чем сложные составные фамилии. Встречается преимущественно в Башкортостане, Татарстане и в диаспорах этих народов в Челябинской, Оренбургской областях.