Фамилия Мурнукова — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа «мурнук» не встречается в современных словарях русского языка, поэтому для разбора приходится обращаться к диалектам, тюркским заимствованиям и возможным искажениям исходного слова.

Самый вероятный путь образования — через прозвище Мурнук. В русских говорах, особенно на Севере и в Сибири, слово «мурновать» означало «ворчать, брюзжать, говорить невнятно». Отсюда «мурнук» — ворчливый, неразговорчивый или угрюмый человек. Такое прозвище могли дать по характеру: кто-то постоянно бормотал себе под нос, не любил громких разговоров или отвечал нехотя. Суффикс -ук/-юк (в данном случае -ук) типичен для севернорусских и сибирских фамилий, он указывает на носителя признака: например, «злыдень» — злюк, «маленький» — малюк. Мурнук — «тот, кто мурнует», то есть ворчун.

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование, — тюркское происхождение. В татарском и башкирском языках есть корень «мур» — «печать, знак», а также «мурза» (князь). Однако фамилия Мурнукова не укладывается в эту модель напрямую: для тюркской фамилии скорее ожидалось бы окончание -ов/-ев без суффикса -ук или форма вроде Мурзаков. Поэтому версия с прозвищем выглядит убедительнее, хотя полностью исключать диалектное тюркское влияние на юге России нельзя.

Суффикс -ов в окончании фамилии (Мурнуков → Мурнукова) — стандартный патронимический показатель, означающий «сын Мурнука» или «из рода Мурнуковых». Фамилия закрепилась в форме женского рода, как это принято в русской традиции. Географически Мурнуковы встречаются в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает связь с севернорусскими говорами (переселенцы) или с тюркским регионом.

Таким образом, предки современной Мурнуковой с высокой долей вероятности получили фамилию по прозвищу ворчливого, нелюдимого человека, и это прозвище закрепилось за родом в нескольких поколениях.