Фамилия Мурсюкаев — редкий случай, когда почти каждый элемент слова несёт смысловую нагрузку, и разобрать её можно с разных сторон. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского происхождения, образованная по русской модели с суффиксом -ев.

Основа фамилии — «Мурсюкай». В ней выделяется корень «мурс-», который восходит к арабскому «муршид» (наставник, духовный учитель) или «мурсал» (посланник). В тюркских языках, особенно у татар и башкир, эти корни дали имена и прозвища: Мурса, Мурсалим, Мурсали. Вторая часть — «юкай» — может быть уменьшительно-ласкательным формантом (как в именах Айюкай, Бикюкай), то есть «Мурсюкай» — это «маленький Мурса» или «Мурса с лаской». Либо это вариант имени Мурсакай, где «ак» означает «белый» или «чистый», что даёт значение «светлый наставник».

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Мурсюкаев — «сын Мурсюкая». Такая модель типична для русификации нерусских фамилий в Поволжье и Приуралье, особенно среди татар, башкир и чувашей. Если предки были крещёными, фамилия могла закрепиться в XVI–XIX веках при переходе в православие.

Географически фамилия встречается в Башкортостане, Татарстане и Оренбургской области. Встречаются варианты написания: Мурсюкаев и Мурсюкайев (с йотированным окончанием, что ближе к исходному произношению). Однокоренные фамилии — Мурсалиев, Мурсакаев, Мурсекаев — подтверждают ту же модель.

Кем были предки Мурсюкаевых? Скорее всего, носители прозвища Мурсюкай не были знатного происхождения. В тюркской среде такие имена-прозвища давали либо ребёнку в семье муллы или учителя (если опираться на значение «наставник»), либо человеку невысокого роста или младшему в роду (если считать «юкай» уменьшительным). Никаких сведений о дворянстве или массовом расселении фамилии нет — это фамилия крестьянского и мещанского сословия, сохранившаяся в сельской местности.