Фамилия Мустафокулова — яркий пример того, как в русской фамильной традиции закрепляется имя, пришедшее из арабского мира через тюркское посредничество. В основе лежит мужское имя Мустафокул, которое состоит из двух частей: «Мустафа» (по-арабски «избранный», один из эпитетов пророка Мухаммеда) и «кул» (в тюркских языках означает «раб», но в составе имён — «раб Божий», «слуга»). Полное значение цепочки — «раб Избранного», то есть человек, посвятивший себя служению пророку. Это типичная модель мусульманского теофорного имени, где имя Аллаха или пророка соединяется с обозначением рабской преданности.

Фамилия образована по русскому образцу с помощью суффикса -ов, который присоединился к тюркской основе. Женская форма Мустафокулова указывает на то, что носительница — женщина; мужской вариант фамилии — Мустафокулов. Такая модель (основа на согласный + -ов) характерна для фамилий, которые складывались у народов Поволжья, Средней Азии и Кавказа при контакте с русской административной системой. Фамилия не могла появиться раньше, чем имя Мустафокул вошло в обиход, а это произошло не ранее XVII–XVIII веков, когда в тюрко-татарской среде распространились составные имена с компонентом «кул».

Географически фамилия Мустафокулова чаще всего встречается среди народов, говорящих на тюркских языках и исповедующих ислам: у татар, башкир, узбеков, таджиков. В России она особенно распространена в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях, где исторически жили татарские и башкирские общины. В Средней Азии фамилия может писаться как Мустафакулова, с заменой «о» на «а», что отражает местные фонетические нормы.

Редкость фамилии в том, что она сохранила архаичную форму с полным именем в основе, а не с усечённым вариантом (как, например, Мустафин от Мустафа). Это говорит о том, что предок носителя, вероятно, был человеком заметным в своей общине — возможно, муллой, учителем или старшиной, чьё полное имя закрепилось в документах. Никаких сведений о дворянском происхождении или принадлежности к конкретному сословию у этой фамилии нет: она типична для крестьян и горожан, получивших фамилии в XIX – начале XX века при переписях и паспортизации.