Фамилия Мустякимова образована по русской модели от мужского имени или прозвища Мустяким. Основа здесь — арабское имя Мустаким, которое означает «прямой», «правдивый», «идущий верным путём». В исламской традиции это имя связано с эпитетом Бога или с понятием праведности. Фамилия несёт отчётливый тюрко-мусульманский след: такие имена были распространены среди татар, башкир и других народов Поволжья и Урала, где арабская лексика вошла в обиход вместе с исламом.

Суффикс -ов- в фамилии Мустякимова — стандартный русский патронимический формант, указывающий на принадлежность: «чей?» — «Мустякимов», то есть сын или потомок Мустякима. Женская форма Мустякимова — естественное грамматическое изменение для носительницы фамилии. Интересно, что в исходном имени произошла фонетическая замена: твёрдый «к» в арабском варианте (Мустаким) перешёл в мягкий «кь» в русской огласовке (Мустяким) — типичное явление при адаптации восточных имён в русской речи.

Географически фамилия тяготеет к Татарстану, Башкортостану, а также к Оренбургской и Челябинской областям, где исторически жили татарские и башкирские общины. В дореволюционной России носители такой фамилии чаще всего были крестьянами или мещанами, но не исключены и случаи принадлежности к духовенству — муллам, которые нередко брали фамилии по именам предков.

Встречается и вариант написания с одной «с» — Мустакимова, что ближе к арабскому оригиналу. Но форма с «стя» показывает, как имя прижилось в русской среде: через устную передачу, где ударение и произношение сдвинулись под влиянием местных говоров. Редкость фамилии (по данным современных справочников, её носят не более нескольких сотен человек) говорит о том, что род, скорее всего, компактно проживал в одном регионе и не дал массовых ответвлений.