Фамилия Мышакин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Мышака восходит к слову «мышь». Однако не исключено, что основатель рода Мышакиных напоминал мышь по характеру (например, скромностью или склонностью делать большие запасы, скуповатостью). Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мышака, со временем получил фамилию Мышакин. О точном месте и времени возникновения фамилии Мышакин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Мышакин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.