Фамилия Мышаков происходит от прозвища Мышак, которое образовано от существительного «мышь». Возможно, Мышаком называли человека, который одевался в серую, спокойных цветов одежду. Однако не исключено, что основатель рода Мышаковых напоминал мышь по поведению. Он мог отличаться скромным, тихим, спокойным нравом или же быть бережливым, склонным делать большие запасы. Вероятно, что фамилия Мышаков могла быть образована от языческого имени Мышак, восходящего к нарицательному «мышь». Давая младенцу такое имя, как Мышак, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделено это животное. С мышью издавна было связано множество различных примет. Люди верили, что если мыши покидают дом, то быть пожару. Когда мышь прогрызала верхнюю корку у каравая, то считалось, что будет высокая цена на хлеб, если нижнюю — хлеб будет дешевым. Так и прозвище Мышак закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Мышаков. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мышак, со временем получил фамилию Мышаков.