Фамилия Наквас образована от аналогичного прозвища, которое восходит к существительному «наквас» («накваса»), имеющему значение «закваска», то есть состав, вызывающий брожение. Закваска используется для сквашивания молока с целью получения кисломолочных продуктов (сыра, простокваши, кефира, и т. д.), для приготовления теста и напитков (кваса, пива, и др.). Можно предположить, что предок обладателя фамилии Наквас занимался изготовлением кисломолочных продуктов или напитков. Кроме того, так могли прозвать пекаря. В «Ономастиконе» С.Б.Веселовского упоминаются однокоренные фамилии: Семен Накваса, проживающий в Суздале (1455 год) и московский подьячий Федор Наквасин (1636 год).