Фамилия Наполькова образована от прозвища или мирского имени Наполько. Основа здесь — прилагательное «напольный», которое в старых говорах имело несколько значений. Проще всего понять прямой смысл: «напольный» — находящийся в поле, на полу, вне дома. В русских диалектах «напольный» могло означать «полевой», «дикий» (напольная трава, напольный зверь). Соответственно, Напольком могли прозвать человека, который жил или работал в поле — пастуха, сторожа, крестьянина, чей участок земли находился за околицей.

Менее очевидная, но более точная версия связана с социальным статусом. В некоторых регионах «напольными» называли крестьян, не имевших своей усадьбы и живших в чужих избах «на полу», то есть на положении подсоседников или батраков. Если предок носил прозвище Наполек, это могло указывать на безземельного или малоземельного крестьянина, который нанимался в работники.

Суффикс -к- в основе (Напольк-о) типичен для уменьшительно-ласкательных или пренебрежительных форм личных имён и прозвищ в XVI–XVII веках. Патронимический суффикс -ов превратил прозвище отца в фамилию сына: «чей?» — Напольков. Женская форма Наполькова — естественное окончание для фамилий на -ов в русской традиции.

Фамилия редкая и географически привязана в основном к центральным и южным регионам России. Встречается в документах по Воронежской, Тамбовской и Рязанской губерниям, что косвенно подтверждает крестьянское происхождение — именно в чернозёмной полосе была высока прослойка безземельных «напольных» людей. В дворянских родословных эта фамилия не зафиксирована.

Однокоренные фамилии — Напольский, Напольнов, Напольных — различаются суффиксами, но восходят к той же основе. Напольков стоит особняком: суффикс -ов указывает на прямое отчество, тогда как -ский чаще давали по названию местности (село Напольное).