Фамилия Навра — редкая для русской ономастики, и её происхождение стоит искать не в крестьянских прозвищах, а в географических названиях или иноязычных корнях. В отличие от большинства русских фамилий на -ов или -ин, она не имеет типичного патронимического суффикса и представляет собой чистую основу. Это сразу указывает на то, что её носители, скорее всего, не из центральной России, а из регионов, где фамилии закреплялись по другому принципу — например, по названию реки, города или этнонима.

Самая вероятная версия — топонимическая. Навра — это название реки в Литве (приток Нямунаса) и нескольких небольших населённых пунктов в Литве и Латвии. В таком случае фамилия могла возникнуть у выходцев из этих мест: человека, переехавшего в другую губернию, могли записать по месту прежнего жительства — «Навра». Подобные фамилии без суффиксов характерны для балтийского и польского ареалов, где они часто закреплялись за шляхтой или мещанами.

Вторая версия — от литовского или латышского слова, означающего «беда», «нужда» (лит. navė, navera). В этом случае фамилия могла быть прозвищем невезучего или бедного человека. Однако такая гипотеза менее убедительна: прозвища с негативным значением в балтийских языках обычно давали не для фамилии, а для характеристики, и в документах их часто смягчали или заменяли.

Фамилия практически не встречается в старых русских переписных книгах, что подтверждает её позднее появление в России — скорее всего, в XIX–XX веках, в связи с миграцией из Прибалтики или Польши. В советское время носители фамилии могли быть записаны как «Навра» без изменений, так как окончание не склонялось по русским правилам.

С точки зрения словообразования, фамилия не делится на суффиксы: корень навр- и окончание -а (женский род). Мужской вариант — Навра (не склоняется) или Навро (в польской традиции). Встречается также вариант Навроцкий — более типичная польская фамилия с суффиксом -цкий, образованная от того же корня. Если ваши предки носили фамилию Навра, стоит проверить записи метрических книг западных губерний (Виленской, Ковенской, Гродненской) — именно там её следы наиболее вероятны.