Фамилия Недопекина хранит в себе память о прозвище дальнего предка — Недопека. Это прозвище образовано от глагола «недопекать», а в старину так называли сыроватый, не до конца пропеченный хлеб, а также невыход положенного количества хлеба из данного количества муки. Проще говоря, недопёка — это неудавшийся каравай, который пекарь вынул из печи слишком рано.

Есть и другая, более образная версия. Недопекой в переносном смысле могли назвать молодого, неопытного, незрелого человека, который еще «не допекся» в жизни, не набрался ума и опыта. Обе трактовки сходятся в одном: прозвище указывало на какую-то незавершенность, недоделанность.

Чаще всего Недопекой величали ученика пекаря, который еще не освоил всех тонкостей ремесла и то и дело выдавал подгоревшие или сырые изделия. Такое прозвище относилось к разряду «профессиональных» именований и закреплялось за человеком в быту. Примечательно, что на Руси XVI–XVII веков к пекарям относились с особым уважением: если простых людей в документах часто записывали уничижительными формами имен — Федька, Митрошка, Гришка, — то пекарей величали полными именами: Федор, Дмитрий, Григорий. Это подчеркивает почетность хлебного дела, а значит, и прозвище Недопека носило скорее добродушный, наставнический оттенок, чем насмешливый.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Недопекина буквально означает «дочь или жена Недопеки», а в более широком смысле — потомок человека с таким прозвищем. Со временем прозвище закрепилось как родовое имя и передалось детям и внукам, превратившись в фамилию, которая и сегодня встречается у носителей, ведущих свою родословную от того самого пекарского ученика.