Фамилия Негрудская — женская форма фамилии Негрудский, и её происхождение стоит искать не в этнической принадлежности, а в географическом или топографическом прозвище. Основа «негруд» — это не обязательно указание на цвет кожи (хотя такое толкование напрашивается первым). В славянской ономастике куда вероятнее связь с диалектным словом «груда» — куча, возвышение, бугор, а также свалка или груда камней. Приставка «не-» в таком контексте могла означать отрицание: «не-груда» — то есть место, где нет возвышенности, ровный участок, или, наоборот, нечто, что грудой не назовёшь — мелкий, рассыпчатый объект.

Суффикс -ск- (в форме Негрудский) — типичный для фамилий, образованных от названий населённых пунктов. Это значит, что предок носительницы фамилии мог получить её по месту жительства или происхождения — из села, деревни или урочища с названием Негруды, Негрудка, Негрудское. Такие топонимы встречаются в западных регионах бывшей Речи Посполитой — на территории современной Беларуси, Украины и восточной Польши. В белорусском языке слово «груд» (или «груда») означает «сугроб», «куча», а «негруд» — место, где таких куч нет, то есть чистое, ровное поле.

Вторая, менее популярная версия, отталкивается от личного прозвища Негруд. В старину так могли назвать человека со светлой кожей (как антитеза «черному» или «смуглому»), либо того, кто был «не грузным» — лёгкого, худощавого телосложения. Однако эта гипотеза слабее, потому что фамилии на -ский в массе своей дворянские или шляхетские, а не прозвищные (крестьянские чаще оформлялись суффиксами -ов/-ев).

В Российской империи фамилия Негрудская встречалась преимущественно среди польской и белорусской шляхты, а также в среде православного духовенства, которое нередко брало фамилии по названиям своих приходов. Если корни семьи ведут из Могилёвской или Гродненской губернии, то версия с топонимом становится почти доказанной. Сейчас фамилия редкая, и её носители рассеяны по России, Украине и Беларуси, но географический след указывает именно на западные земли.