Оно ведет свое начало от нарицательного «негр» - «чернотелый человек, арап; уроженец знойной Африки». Хотя Негруном человека могли прозвать и за некое сходство с неграми, например, за смуглую кожу, темные волосы, глаза. Нельзя исключать также, что прозвище Негрун этимологически связано с глаголом «греть». Соответственно, такое прозвище могло закрепиться и за равнодушным, холодным человеком. Согласно еще одной гипотезе, фамилия Негрун восходит к топониму Негрыш — город в Тверской области России.