Фамилия Неманихина — женская форма фамилии Неманихин, которая относится к редкому типу русских фамилий с суффиксом -ихин. Этот суффикс характерен для северных и северо-восточных регионов России, особенно для Архангельской, Вологодской и Вятской губерний. Если фамилия оканчивается на -ихин, её основа почти наверняка происходит от прозвища или имени, которое заканчивалось на -иха. В данном случае исходным было прозвище Неманиха.

Корень «неманиха» сложен для однозначного толкования. Первое, что приходит на ум, — связь с глаголом «манить» (звать, привлекать) или с существительным «ман» (обман, приманка). Приставка «не-» могла указывать на отрицание: «неманиха» — та, что не манит, не привлекает, не обманывает. Однако в русских говорах слово «маниха» имело и другое значение — так могли называть корову или лошадь, которая отказывается идти, упрямится. В этом случае «неманиха» — животное, которое не поддаётся на приманку, или, в переносном смысле, человек с тяжёлым, несговорчивым характером.

Вероятнее всего, прозвище Неманиха дали женщине — жене или вдове, которую в округе знали как «неприступную», «суровую» или, наоборот, как «неподкупную» и «необманываемую». Суффикс -их- в прозвищах часто указывал на принадлежность к мужу: например, Петриха — жена Петра. Но «Неманиха» не имеет очевидного мужского аналога (Неман?), поэтому версия о личном прозвище женщины выглядит убедительнее. В северных деревнях женщину могли прозвать по её поведению или занятию, и это прозвище закреплялось за всей семьёй.

Фамилия Неманихина почти не встречается в центральных и южных регионах. Основной ареал — северные области, где фамилии на -ихин и -иных сохранялись дольше всего. Это не дворянская фамилия: в списках служилых людей и помещиков она не фиксируется. Скорее всего, предки Неманихиных были крестьянами или посадскими людьми. В XIX веке фамилия могла писаться через «а» или «о» в корне (Неманихина и Немонихина), но современная орфография закрепилась с буквой «а».

Сравните с однокоренными фамилиями: Манихина (от «маниха»), Обманихина (от «обманиха»), Поманихина. Все они редки и указывают на прозвища, связанные с поведением или внешностью. Фамилия Неманихина стоит в этом ряду особняком из-за отрицательной приставки, что делает её значение противоположным — не «привлекающая», а «отталкивающая» или «стойкая».