Фамилия Немтуров — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, не просто угадывается, а почти наверняка связано с тюркским словом «немту» или близким к нему. В тюркских языках (особенно в казахском, башкирском, татарском) «немту» означает «немой» или «безъязыкий». Так могли прозвать человека, который не говорил на местном наречии, — приезжего из другого племени или области, либо того, кто потерял дар речи после болезни. Не исключено, что прозвище давали и просто молчаливому, неразговорчивому человеку.

Суффикс -ов указывает на русскую модель фамилии, типичную для XVI–XVII веков. Носители фамилии Немтуров — это потомки человека по прозвищу Немту, который жил среди тюркоязычного населения, но затем попал в русскую среду, где фамилию оформили по привычному отчеству: «чей?» — Немтуров. Встречается она в основном в регионах Поволжья и Урала, где исторически смешивались русские, татары и башкиры. Возможен и вариант происхождения от имени Немту — личного имени-оберега, которое давали, чтобы отвести от ребёнка злые силы: считалось, что названный немым будет здоровым и говорливым.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Немтуев, Немтулин — подтверждает тюркскую основу. Если Немтуев образован с помощью тюркского суффикса принадлежности, то Немтуров — уже результат русификации. Фамилия недвусмысленно говорит о географическом и культурном стыке: её носители — выходцы из среды, где русский язык соседствовал с тюркскими, а прозвища часто отражали языковой барьер. Никакого другого, «благородного» корня у неё нет — это бытовая, крестьянская или посадская фамилия, без связи с дворянскими родами.