Фамилия Нигаматзянов — яркий пример того, как тюркское имя, пройдя через русскую словообразовательную модель, превратилось в фамилию, характерную для татарской и башкирской среды. Её основа — арабское имя Нигаматзян (встречаются варианты Нигматзян, Нигматулла), которое состоит из двух частей: «нигамат» (в арабском — «благодать», «благо», «милость») и «зян» (искажённое персидское «джан» — «душа»). Полное значение — «душа благодати» или «милость души», то есть имя с пожеланием человеку быть одарённым божественной милостью.

Фамилия образована по самой распространённой в России патронимической модели: к имени отца Нигаматзян добавили русский суффикс -ов, который указывает на принадлежность («сын Нигаматзяна»). Однако финальное -ов здесь не просто грамматический суффикс — он «прирос» к основе, потому что имя уже заканчивалось на -ян. В результате получилась форма Нигаматзянов, где ударение, скорее всего, падает на третий слог: Нигаматзя́нов. Это типично для татарских фамилий, которые в XIX — начале XX века массово русифицировались при записи в метрические книги.

Географически фамилия плотно привязана к Волго-Уральскому региону, особенно к Татарстану и Башкортостану. Встречается она и в соседних областях — Оренбургской, Челябинской, Самарской. Носители фамилии почти поголовно — потомки татар или башкир, крещённых или мусульман, но записанных по-русски. Интересно, что в самой татарской среде фамилия могла звучать как Нигаметзянов или Нигматзянов — разница в первой гласной (и/е) отражает диалектные особенности произношения имени Нигматулла.

С точки зрения социального контекста, Нигаматзяновы — это потомки крестьян, ремесленников или торговцев, а не аристократии. В отличие от княжеских фамилий на -ский, эта фамилия не даёт намёка на сословную привилегию, зато прямо говорит о вероисповедании предка: имя Нигаматзян — мусульманское, и его давали в среде исламизированных тюркских народов. В советское время фамилия нередко сокращалась до Нигаматов или Нигматов, но полная форма сохранилась у многих семей, особенно в сельской местности.

Если искать параллели, то однокоренные фамилии — Нигаматуллин, Нигматуллин, Нигаматзянова (женский вариант) — все они восходят к тому же арабскому корню «н-г-м» со значением «благодать». Разница лишь в том, какая часть имени стала основой: Нигаматзянов — от полного двусоставного имени, а Нигаматуллин — от формы «Нигаматулла» («милость Аллаха»).