Фамилия Нигаматянова — редкий случай, когда исходное имя, лёгшее в основу, почти полностью сохранило свою форму, а суффикс безошибочно указывает на регион происхождения. Это женская форма фамилии Нигаматянов, которая образована от мужского имени Нигаматян. Само имя восходит к арабскому «Нигматулла» (Ni‛matullāh) — «милость Аллаха», «благодать Божья». В тюркских языках, особенно в татарском и башкирском, это имя давали с пожеланием, чтобы жизнь ребёнка была наполнена благополучием и божественной защитой.

Словообразовательная цепочка здесь прозрачна: полное имя Нигаматян (фонетический вариант от Нигматулла) плюс русский патронимический суффикс -ов/-ев, который в Поволжье и Приуралье приращивали к тюркским именам при формировании фамилий в XVIII–XIX веках. Суффикс -анов в данном случае не является самостоятельным — это часть основы: Нигамат-ян-ов. Фамилия закрепилась в среде татар и башкир, где переход арабских имён через тюркскую огласовку давал такие формы: усечение конечного -улла и добавление уменьшительно-ласкательного -ян (как в именах Алмазян, Рафисян).

Географически фамилия Нигаматянова встречается преимущественно в Башкортостане и Татарстане, реже — в соседних областях (Челябинская, Оренбургская). В дореволюционных метрических книгах Уфимской губернии можно найти записи о Нигаматяновых среди государственных крестьян и тептярей — сословной группы, сочетавшей земледелие с несением повинностей. В отличие от многих русских фамилий, образованных от прозвищ, эта фамилия сохранила прямую связь с религиозным именем, что говорит о сохранении исламской традиции именования в семье.

Интересная деталь: у фамилии есть однокоренные варианты — Нигматуллин, Нигматов, Нигматьянов. Разница в суффиксах отражает разные способы адаптации одного и того же арабского корня: -уллин (буквально «из рода Аллаха»), -ов (чисто русская модель) и -янов (с тюркским ласкательным аффиксом). Нигаматянова стоит в этом ряду как форма, где имя взяли почти целиком, лишь добавив родовой суффикс. По написанию фамилия не имеет альтернативных вариантов — двойное «а» в корне (Нигамат- вместо Нигмат-) закрепилось в документах и передаётся по наследству.