Фамилия Нигматьянова — одна из тех, что пришли в русский обиход из тюркского мира, и её разбор требует понимания не только суффиксальной модели, но и корня, который уходит в арабский язык через посредничество татарского или башкирского. Основа здесь — мужское имя Нигматьян. Это сложное имя, составленное из двух арабских корней: «нигмат» (نعمة — «благо», «милость», «благодать») и «ян» (персидский компонент جان — «душа»). В сумме имя Нигматьян можно перевести как «душа благодати» или «милостивая душа». Форма Нигматьянова — это притяжательное прилагательное с суффиксом -ов, указывающее на принадлежность: «дочь (или жена) Нигматьяна». В русской традиции фамилия закрепилась в женском роде с окончанием -а, хотя исходная мужская форма выглядела бы как Нигматьянов.

Географически эта фамилия почти наверняка указывает на татарское или башкирское происхождение, реже — на казахское, где имя Нигматьян (или Нигметжан) тоже встречается, но с другим ударением. В Поволжье и на Урале, особенно в Татарстане и Башкортостане, такие фамилии на -ов/-ев массово появлялись в XIX веке при переходе тюркских народов к оседлому образу жизни и записи в метрические книги. Интересная деталь: в дореволюционных документах фамилию могли писать через «е» — НигметьЯнов, что отражает местное произношение, где первый гласный редуцируется. Это не ошибка, а живой след устной речи, который потом унифицировали при советской паспортизации.

Спорных версий у этой фамилии немного. Иногда её путают с Нигматуллин (от арабского «нигматулла» — «благо Аллаха»), но разница очевидна: в Нигматьянове нет компонента «улла» (Бог), а есть «ян» (душа). Это разные антропонимические модели, хоть и одного корня. Если предки носителя фамилии были крестьянами или ремесленниками, то имя Нигматьян им давали скорее как благопожелательное: ребёнка нарекали в надежде, что его душа будет полна блага. Сословной привязки нет — фамилия встречается и у сельских жителей, и в городской среде, что типично для татарских патронимических фамилий, не маркированных как дворянские.