Фамилия Никанюк — яркий пример того, как по суффиксу можно определить географию происхождения. Суффикс -юк типичен для западноукраинских и белорусских фамилий, особенно распространённых на Волыни, в Полесье и на Подолье. Он выполняет ту же роль, что и русские -ов/-ев или -ин: указывает на принадлежность, родство, младшего члена семьи. Таким образом, Никанюк — это «сын Никана» или «потомок Никана».

В основе фамилии лежит каноническое мужское имя Никан. Это сокращённая, народная форма от полного церковного имени Никандр (греч. Νίκανδρος — «побеждающий мужей»). В быту имя Никандр нередко усекали до Никан или Никанор (хотя последнее — самостоятельное имя). Поэтому Никанюк — это типичная «патронимическая» фамилия, образованная от разговорного варианта крестильного имени.

Интересно, что фамилия Никанюк встречается реже, чем, скажем, Никандров или Никаноров. Причина в том, что суффикс -юк прижился в основном в крестьянской среде, где имя Никандр было не таким частым, как, например, Иван или Пётр. А вот «собратья» по суффиксу — Богданюк, Степанюк, Романюк — гораздо многочисленнее. Никанюк же остался более редкой, локальной фамилией, что делает её своеобразным маркером: носители, скорее всего, происходят из конкретного села или района, где имя Никан было в ходу несколько поколений подряд.

В дореволюционных документах фамилию могли записывать по-разному: Никанюк, Никонюк (под влиянием аканья или путаницы с именем Никон), а также с окончанием -ук (Никанюк vs Никанчук — уменьшительная форма). Но современное написание с «я» — наиболее устойчивое и точно передаёт исходное произношение.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: связь с прозвищем Никаня — от глагола «никать» (кланяться, сгибаться) или «никать» в диалектном значении «шататься, бродить без дела». Но в контексте фамилий на -юк, которые почти всегда патронимические, версия с именем Никандр выглядит гораздо убедительнее.