Фамилия Никиченко образована по одной из самых распространённых в украинской и южнорусской ономастике моделей — с суффиксом -енко, который изначально означал «сын» или «потомок». В прямом смысле Никиченко — это «Никичин сын» или «маленький Никита». Основа здесь — не полное имя Никита, а его производная, разговорная форма Никич или Никика. Такие сокращённые варианты имён были в ходу в быту: от полного Никита образовывали Никичка, Никиша, Никич, и уже от них — фамилии на -енко. Фамилия Никиченко, таким образом, относится к патронимическим — тем, что указывают на отца или главу семьи.

Географически фамилия тяготеет к левобережной Украине и южным областям России. В переписях и ревизских сказках XIX века носители фамилии Никиченко чаще всего встречаются в Полтавской, Харьковской и Екатеринославской губерниях. Это зона активного бытования фамилий на -енко, которые в XVII–XVIII веках вытеснили более архаичные формы на -ов и -ин в казацкой среде. Можно предположить, что предки современных Никиченко были либо казаками, либо крестьянами, но фамилия не даёт точного указания на сословие — патронимы на -енко носили все слои населения, от старшины до крепостных.

Интересная деталь: в отличие от фамилии Никитин (от полного имени) или Никитов (от той же основы, но с другим суффиксом), Никиченко сохранила уменьшительно-ласкательный оттенок. Если Никитин — это «принадлежащий Никите», то Никиченко — «сын Никички», то есть форма более личная, домашняя. Такое различие часто теряется при поверхностном взгляде, но для этимолога оно важно: оно показывает, как в фамилии застыло не просто имя, а то, как человека называли в семье.

Встречаются также варианты написания — Никиченко, реже Никичёнко (с ударением на последний слог). В русской традиции ударение обычно падает на второй слог — НикИченко, хотя в украинском произношении возможен вариант с ударением на «е». Фамилия нередкая, но и не массовая: в современных базах данных она встречается в десятки раз реже, чем Никитин или Никифоров. Это объясняется именно региональной привязкой — за пределами юга России и Украины она почти не встречается.

Таким образом, Никиченко — это типичная украинская патронимическая фамилия, образованная от уменьшительной формы имени Никита. Предки носителя, скорее всего, жили на территории современной Украины или юга России, а сама фамилия закрепилась в казацкую эпоху, когда суффикс -енко стал главным маркером «сыновства» в фамилиях.