Фамилия Никишенкова хранит память о мужском имени Никита, которое пришло на Русь из греческого языка и переводится как «победитель». Однако путь от имени до фамилии не прямой, и в нём скрыта любопытная словообразовательная цепочка. Основой послужила не сама каноническая форма, а её просторечный, обиходный вариант — Никиша. Такие уменьшительно-ласкательные или, точнее, бытовые формы имён в старину были распространены повсеместно: их использовали в семье, среди соседей, в трудовой артели.

Дальше начинается самое интересное — география и суффиксы. В украинских и южнорусских землях от формы Никиша легко могли образовать фамилию Никишенко (по модели «чей сын»: Никишин, Никишенко). А вот конечное -ов в варианте Никишенков указывает на иной путь. Скорее всего, предки носителя этой фамилии носили форму Никишенко, а уже после переезда в великорусские губернии фамилию «обрусели», добавив типичный для северной традиции суффикс -ов. Так Никишенко превратился в Никишенкова, и эта версия выглядит правдоподобнее, чем предположение об образовании напрямую от Никиши.

Сам суффикс -енко в основе фамилии — верный признак того, что родоначальник жил на территории современной Украины или в пограничных с ней русских уездах, где эта модель была господствующей. Позднейшая русификация через -ов — частое явление для XVIII–XIX веков, когда крестьян и мещан переселяли, а писари в новых местах записывали фамилии «на местный лад».

Что касается сословия, то здесь данные косвенные, но показательные. Фамилии на -енко и их производные в массе своей закрепились за простыми людьми: казаками, крестьянами, мещанами. Дворянские роды чаще носили фамилии на -ов/-ев от полных крестильных имён или прозвищ. Поэтому мы можем уверенно говорить: основатель рода Никишенковых, носивший имя Никита или его форму Никиша, был человеком незнатного происхождения. Скорее всего, его звали просто Никиша, без отчества в официальных бумагах, а потомки уже получили фамилию по этому домашнему имени.

Итоговая картина складывается такая: имя Никита («победитель») → бытовая форма Никиша → фамилия Никишенко (указывает на сына или потомка Никиши) → русифицированный вариант Никишенков после переселения в великорусские земли. Сегодня фамилия Никишенкова встречается в основном в центральной России и Поволжье, куда предки могли перебраться в поисках лучшей доли. В каждом таком переезде и в каждом добавленном суффиксе — живая история конкретной семьи, а не просто грамматическое правило.