Фамилия Никишков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Никишков послужило мирское имя Никиша. Фамилия Никишов образована от крестильного мужского имени Никита, точнее – от его производной уменьшительно-ласкательной формы Никиша. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Никиша, со временем получил фамилию Никишков. О точном месте и времени возникновения фамилии Никишков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Никишков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.