Фамилия Никишов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Никишов послужило церковное имя Никита. Фамилия Никишов образована от крестильного мужского имени Никита, точнее – от его уменьшительно-ласкательной формы Никиша. Покровителем этого имени читался преподобный Никита Исповедник. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Никиша, со временем получил фамилию Никишов. О точном месте и времени возникновения фамилии Никишов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Никишов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.