Фамилия Никишурина — женская форма, а мужская выглядит как Никишурин. Её основа — имя Никиша, которое в свою очередь является производной формой от канонического имени Никита. В русской народной традиции имя Никита часто сокращали и переделывали: Никиша, Никишка, Микита. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Никишурин, то есть сын или потомок Никиши.

В отличие от более распространённых фамилий на -ов (Никитов, Никитин), форма Никишурин встречается реже. Дело в том, что суффикс -ин обычно присоединяли к основам, оканчивающимся на -а или -я: Никиша — Никишурин, Кузьма — Кузьмин, Фома — Фомин. Таким образом, фамилия чётко фиксирует, что в основе лежало не полное имя, а его обиходный, уменьшительный вариант. В дореволюционной России такие фамилии часто бытовали в среде крестьян и посадских людей, где в быту использовали именно сокращённые имена.

Географически фамилия Никишурин тяготеет к центральным и южнорусским регионам, а также к Поволжью. Встречается она и в украинских говорах, где форма Никиша также была обычна. Если проследить по архивным записям XIX века, то Никишурины чаще всего числились государственными или помещичьими крестьянами, реже — мещанами.

Любопытная деталь: двойное -ш- в корне (Никиша → Никишурин) могло возникнуть под влиянием диалектного произношения, где звук «ш» смягчался и удваивался. Это делает фамилию не просто указанием на предка по имени Никита, а маркером определённой языковой среды, где такие формы были в ходу.