Основой фамилии Никодимов послужило церковное имя Никодим. Имя Никодим в переводе с греческого означает «побеждающий народ». В истории христианства известны несколько святых, благодаря которым это имя вошло в святцы: преподобный Никодим, праведный Никодим, тайный ученик Иисуса Христа, святитель Никодим архиепископ Сербский, преподобный Никодим Святогорец, преподобный Никодим Кожеезерский, преподобный Никодим Метеорский и преподобный Никодим, просфорник Печорский. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Никодим, со временем получил фамилию Никодимов.