Фамилия Николис — редкая для России и чаще встречается в греческой, итальянской или румынской среде. Её основа — личное имя Николас, греческая форма имени Николай (от греч. «никэ» — победа и «лаос» — народ, то есть «победитель народов»). В русском контексте фамилия могла появиться через греческих переселенцев, купцов или моряков, которые оседали в южных портовых городах — Одессе, Таганроге, Мариуполе. В отличие от типично русских фамилий на -ов/-ев или -ин, модель на -ис (с ударением на последний слог) выдает иноязычное происхождение: в греческом суффикс -ис часто указывает на принадлежность или происхождение («сын Николаса»).

Вероятнее всего, фамилия образована напрямую от имени Николас без дополнительных суффиксов — так называемая «чистая» патронимическая модель, характерная для новогреческого языка. Менее правдоподобна версия о связи с латинским или румынским словом «nicolis» (от «nicol» — копье, дротик), так как это слово не зафиксировано в живых языках как прозвище. Если фамилия встречается у славян, то, скорее всего, это поздняя запись греческой фамилии при переезде, а не исконно славянское образование.

Географически фамилия Николис рассеяна: в Греции она встречается в регионе Пелопоннес и на островах, в Италии — на Сицилии и в Калабрии (как вариант Николис, Николисси). В России носители этой фамилии — единицы, и, как правило, это потомки греческих беженцев или моряков, осевших в XIX–XX веках. Сословной привязки нет: предки могли быть как ремесленниками, так и торговцами, а в приморских городах — капитанами или матросами. Ударение в русском языке чаще падает на последний слог — Николис, хотя в греческом оригинале ударение на первый слог (Николас).