Фамилия Никонеко — одна из тех, что сразу привлекает внимание своей необычной концовкой. Если большинство русских фамилий заканчивается на -ов, -ин или -ский, то здесь мы видим суффикс -енко, который кричит об украинском или белорусском происхождении. В ономастике это так называемый «патронимический» суффикс, который буквально означает «сын» или «потомок». То есть Никоненко — это «сын Никона». Фамилия образована от канонического мужского имени Никон, которое пришло на Русь вместе с христианством из Византии. Само имя Никон греческого происхождения и переводится как «побеждающий» (от греческого слова «нике» — победа). Так что ваш предок, скорее всего, был человеком по имени Никон, а его дети или внуки получили фамилию по отцу.

С географической точки зрения фамилия Никоненко, а соответственно и её вариант Никонеко (который, вероятно, является диалектным или записанным на слух искажением), традиционно распространена на территории современной Украины, особенно в её центральных и восточных областях, а также в южных регионах России, куда активно переселялись украинские крестьяне в XVIII–XIX веках. Встречается она и в Беларуси. Любопытно, что окончание -еко вместо более привычного -енко может быть результатом местного говора или особенностей записи фамилии в документах — например, писарь мог записать её на слух именно так, и вариант закрепился.

Что касается социального статуса, то фамилии на -енко в массе своей принадлежали крестьянскому и казачьему сословиям. В среде запорожских казаков и черкас такие фамилии были особенно распространены, так как указывали на происхождение от конкретного человека, а не на владение землёй. Поэтому с большой долей вероятности носитель фамилии Никонеко — потомок крестьянина, казака или мещанина с Украины, чей отец или дед носил имя Никон. Имя это было не самым редким, но и не сверхпопулярным, так что фамилия встречается не повсеместно, что делает её довольно узнаваемой.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то здесь же можно вспомнить Никонова (русский вариант с суффиксом -ов) или Никончука (ещё один украинский патроним с суффиксом -ук). Никонеко стоит в этом ряду как типичный представитель южнорусской ономастической традиции, где ударение в фамилии чаще всего падает на второй слог — Нико́неко. Эта простая, но выразительная словообразовательная модель сразу даёт понять: перед вами фамилия, которая говорит о родстве, а не о ремесле или внешности.